微生物肥料是活体肥料，它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活动代谢来完成。只有当这些有益微生物处于旺盛的繁殖和新陈代谢的情况下，物质转化和有益代谢产物才能不断形成。因此，微生物肥料中有益微生物的种类、生命活动是否旺盛是其有效性的基础，而不像其它肥料是以氮、磷、钾等主要元素的形式和多少为基础。

正因为微生物肥料是活制剂，所以其肥效与活菌数量、强度及周围环境条件密切相关，包括温度、水分、酸碱度、营养条件及原生活在土壤中土著微生物排斥作用都有一定影响，因此在应用时要加以注意。

近年来，微生物菌因其具有改善土壤理化性状、提高农产品产量和品质的功效，日益受到市场的欢迎，但因见效慢、产品质量参差不齐等原因，市场推广受到影响。

微生物菌剂是指目标微生物(有效菌)经过工业化生产扩繁后，利用多孔的物质作为吸附剂(如草炭、蛭石)，吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂。这种菌剂用于拌种或蘸根，具有直接或间接改良土壤、恢复地力、预防土传病害、维持根际微生物区系平衡和降解有毒害物质等作用。

农用微生物菌剂恰当使用可以提高农产品产量、改善农产品品质、减少化肥用量、降低成本、改良土壤、保护生态环境。

按剂型可分为：液体、粉剂、颗粒型；

按内含的微生物种类或功能特性可分为：根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等；

按照复合方式分为：单一微生物菌剂和复合微生物菌剂。

1、减少病虫害，增强作物的抗病能力。

微生物肥料中的有益微生物在作物根系周围大量生长繁殖，形成优势菌群，占据病原微生物的生存空间，阻挡了病原微生物对作物的侵害。其次，微生物所分泌的杀虫抗菌类物质，具有一定的杀虫抗菌作用。这些物质在根部能够增强了作物的抗病能力，使作物避免土传性病原菌的侵害，降低发病率。

2、促进生长，增加产量。

使用微生物肥料后，微生物产生的如赤霉素、生长素和其他生理活性物质，促进了作物的生长发育，特别是根系发育，发达的根系提高了作物养分吸收能力，使作物的生长发育速度加快。尤其是一些光合细菌制剂，喷洒在作物叶面后，作物枝叶茂盛，叶面积增大，使作物的光合作用显著增强，作物生长加速，开花早、结果多、产量高。

3、改善产品品质。

由于微生物的活动，均衡了土壤中养分的供应，防止了作物对N素肥料的过量吸收，蛋白质、糖分、维生素含量提高，硝酸盐含量下降，作物品质明显改善，口味好、保鲜时间延长。据实验测定，施用微生物肥可使产品中硝酸盐含量降低20-30％，维生素C含量提高30-40％，可溶性糖提高1-4度。可以有效地改善蔬菜和果品的外观，提高氨基酸含量、降低重金属等有害物质含量。

4、改善土壤结构，提高土壤肥力。

微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，占土壤有机质的0.1%，与植物粘液，矿物胚体和有机胶体结合在一起，可以改善土壤团粒结构，增强土壤的物理性能和减少土壤颗粒的损失，在一定的条件下，还能参与腐殖质形成。所以施用微生物肥料能改善土壤物理性状，有利于提高土壤肥力。

5、提高化肥利用率。

微生物菌剂有效菌大多能分解土壤中有机质，有机质分解过程中生成腐殖酸，腐殖酸与土壤中的氮形成腐殖酸铵，可减少氮肥的流失。解钾溶磷有效菌能将土壤中固化的化学钾肥、化学磷肥分解转化为速效钾、速效磷，提高其利用率，降低生产投入，减少资源浪费。

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