菌肥当中含有多种有益微生物，能够改善土壤结构，促进农作物更好的吸收土壤中的营养，很多人反映，生物菌使用之后，并没有多大的效果，那么效果不明显的原因是什么呢？

1、土壤菌肥不匹配

土壤有酸碱之分，生物菌肥也是多种多样的，中性和微酸性土壤宜施细菌性有机菌肥。碱性土壤宜施丝状微生物的藻类有机菌肥，施用后能固定空气中的氮，帮助果树利用其他状态存在的氮素养分。而酸性土壤施了碱性有机菌肥，酸碱中和降低了肥效，也使菌种受到伤害。有些菌是需氧性很强的菌种，如放线菌、霉菌类等施在板结透气性差的土壤中，别说发酵繁殖，菌种本身都难以成活。

2、土壤理化性状恶化

菌肥中的菌赖以生存的条件是有机质。而我国大部分土壤板结问题严重，土壤透气性差，使得一些厌气菌大量繁殖，如镰刀菌、齐整小核菌等。

更严重的是有机质极度缺乏破坏了土壤的团粒结构，降低了土壤的保肥保水能力。没有了有机质，菌肥中的菌种就失去赖以生存的条件不能繁衍生存，也就无法发挥作用。

3、土壤不利于微生物存活

果园多年不施有机肥和浅施无机肥，造成土壤板结，存氧量差，根系生长缓慢。土壤pH值发生变化。除草剂在土壤中的残留直接破坏了土壤的团粒结构使土壤中的微生物死亡。